热带药用植物化学教育部重点实验室，在学校第一批重点实验室“天然产物与有机合成化学实验室”的基础上，2005年由海南省科技厅批准筹建海南省重点实验室，2009年9月通过海南省科技厅的验收。2010年5月通过教育部专家论证正式开始立项建设教育部重点实验室，2013年6月实验室验收中获得教育部专家组的一致好评，2014年1月热带药用植物化学教育部重点实验室启动运行。2017年2月，通过了教育部组织的重点实验室评估。2013年，“热带药用植物化学成分与药理活性研究”创新团队入选教育部创新团队发展计划培育团队，2017年获得教育部为期三年的滚动支持。实验室以海南热带药用植物资源为研究对象，以有机化学学科为基础，运用化学、生物学、药物化学和现代波谱分析和仪器分析等手段，开展药用植物化学成分的结构测定、生物活性与功能、结构修饰与合成、提取和分离工艺的研究，与相关学科结合，为我国尤其是海南省的创新植物药和中药现代化作贡献。