实验室立足于海南岛这一独特的热带生物地理单元和海岛复合生态系统，辐射南海岛礁，结合一带一路建设和海洋强国战略，运用生态学、生物地理学、生物系统学、保护生物学和行为学等理论与方法，对四眼斑水龟、青皮等热带濒危物种的多样性及其种群生态进行研究，为物种的有效保护和科学管理提供理论依据和实践指导;开展对红耳龟、假臭草等外来物种的入侵生态适应机制研究，建立海南生态安全的预警和防控体系;结合海南沿海防护林建设，开展对红树林湿地的长期动态监测和服务功能价值评估，研究海岸植被生态系统退化的生态学过程与机理、生态修复与重建的技术和方法;通过对岛屿物种与大陆物种的系统演化和亲缘地理学的比较，探讨岛屿物种的形成及其种间互作，特别是鸟类巢寄生行为的协同进化;通过分子标记技术和分子检测技术来比较生物大分子结构和功能的差异，以揭示热带生物与环境相互作用的分子机理，探讨热带生物对岛屿环境的适应性进化以及对全球气候变化的响应。